生物訊息設施
如果您在連接 sFTP 服務器時收到「Authentication failed; Critical error: Could not connect to server」（身份驗證失敗；嚴重錯誤：無法連接到服務器）的報錯。
這可能是由於用戶名稱或密碼中包含某些「容易混淆」的字元，例如 “I”、“1”、“0” 或 “O”。建議您複製並貼上連接信息以重新嘗試。
如果您在連接 sFTP 服務器時遇到「ssh_init: Host does not exist; Could not connect to server」（主機不存在；無法連接到服務器）的報錯。
此錯誤可能是由您的網絡封鎖了我們的 sFTP 服務器或網絡不穩定所致。請嘗試切換其他網絡重新連接。此外，由於 Wi-Fi 連線可能不穩定，強烈建議您使用更穩定的網絡連接（例如有線局域網 LAN）來下載檔案。
如果您在從 sFTP 服務器下載檔案時收到「error while writing local files」（寫入本地文件時發生錯誤）的報錯。
此錯誤可能是由電腦磁碟空間不足或網絡不穩定所致。請檢查您的硬盤是否有足夠的剩餘空間來儲存數據。此外，由於 Wi-Fi 連線可能不穩定，強烈建議您使用更穩定的網絡連接（例如有線局域網 LAN）來下載檔案。
如果您無法使用提供的密碼解壓第二個壓縮檔(zip.002)。
zip.001 和 zip.002 是原始資料夾的分割壓縮檔。您只需要解壓 zip.001，其餘的壓縮檔（zip.002 及／或 zip.003（如有））將會自動解壓到同一個資料夾中。因此，除 zip.001 外，請勿手動解壓其他壓縮檔。
如果您在解壓過程中遇到「Cannot open the file as zip archive」（無法將檔案作為 zip 壓縮檔開啟）的報錯。
![Cannot open the file as [zip] archive](../wp-content/uploads/2021/06/BF_FAQ_DataExtractionQ2.png)
檔案受損。請確保您已按照指示下載檔案，並使用 WinMD5Free 驗證檔案完整性。
如果您在解壓時因「Wrong password」（密碼錯誤）而無法解壓。
這可能是由於密碼中包含某些「容易混淆」的字元，例如 “I”、“1”、“0” 或 “O”。建議您複製並貼上密碼以重新進行解壓。
如果您解壓後的檔案不包含任何數據 (0KB)。
檔案可能由於解壓密碼錯誤而未能成功解壓。建議您複製並貼上密碼以重新進行解壓。
如果您在檔案解壓過程中收到其他錯誤訊息。
使用我們推薦的解壓軟件 (7zip) 通常可以解決該錯誤。如果使用 7zip 後問題仍然存在，請與我們聯絡。
如果您想了解 CPOS 生物訊息學分析服務所提供的交付内容。
對於標準化分析，請參考不同項目類型的交付内容列表。如果您希望獲得額外的交付内容，請與我們聯絡以進一步討論。
如果您想了解標準生物訊息學分析的周轉時間／交付時間。
標準生物訊息學分析的周轉時間約為 2 星期（在原始測序數據備妥且預先收到所需信息（例如樣本物種、比較清單）後起計算）。
如果您想了解您的測序數據是否包含接頭序列 (adapter sequences)。
一般而言，測序數據會包含接頭序列。在 MiSeq 測序服務中，只有在收到要求時才會切除接頭。
如果您需要測序數據的接頭信息。
如果您想為測序數據切除接頭，可以參考本網站中的第一對接頭序列：
Read 1: AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA
Read 2: AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT
進行下游分析之前，請緊記檢查已切除接頭的 fastq 文件。
如果您打算在 Partek Genomics Suite 中分析 2021 年 7 月或之後提供的 Partek 項目。
由 2021 年 7 月起，RNA-Seq 分析中所提供的 Partek 項目檔案格式將由 “.ppj” 更改為 “.zip”。
要匯入項目，請點擊 “File”（文件） -> “Import”（匯入） -> “Zipped Project…”（壓縮項目…） -> 選擇要匯入的項目。
** 其他 PGS 的事項維持不變。
如果您在 Partek Genomics Suite 進行通路分析期間被要求提供「探針組註釋 (Probeset Annotation)」。
要進行指定，請點擊 “Browse”（瀏覽） -> 選擇您比較的對應文字檔。
(e.g. AvsB_Partek_Gene_Diff.txt / AvsB_Partek_Isoform_Diff.txt) -> 點撃 "OK"
蛋白質組學及代謝物組學設施
典型蛋白質鑑定中所獲得的序列覆蓋率是多少？
一般而言，每個蛋白質的序列覆蓋率介乎 10% 至 90% 之間，這取決於蛋白質的豐度及蛋白質本身的性質。
獲得不理想質譜數據的最常見原因是什麼？
原因包括：
1. 使用了與質譜檢測不相容的染色方法；
2. 樣本中存在離子抑制試劑（例如聚合物、清潔劑及甘油）；
3. 污染性蛋白質過載（例如親和純化中的抗體，以及血清樣本中的高豐度蛋白質）；
4. 蛋白質的特定性質（例如高度修飾的蛋白質、特定蛋白質中含有極少量的賴氨酸與精氨酸殘基）。
如何避免角蛋白污染？
角蛋白是最常見的蛋白質污染物，主要來自人類的皮膚和頭髮，有時亦來自羊毛衫等衣物。以下為避免樣本受到角蛋白污染的建議：
1. 在清潔的實驗室及乾淨的實驗檯面上工作；
2. 使用來自密封盒的吸頭及微量離心管；
3. 設備在使用前應用潔淨水沖洗（例如瓶子、玻璃板、電泳設備、染色盤）；
4. 在進行樣本製備及酶解過程中必須全程佩戴手套。切勿用手指直接觸摸凝膠，亦切勿戴着手套觸摸頭髮或皮膚。
預計何時可以取得分析結果？
典型服務週期（交付時間）如下：簡單的蛋白質圖譜分析 (Protein Profiling)／翻譯後修飾鑑定 (PTM IDs)、標靶代謝物定量例行服務（GC-MS/MS 及 LC-MS/MS）為 2 星期；蛋白質鑑定及定量（無標記蛋白質定量 Label-free）為 3 星期；基於標記的蛋白質鑑定及定量（TMT/iTRAQ）為 4 星期；基於標記的磷酸化蛋白質組學服務則為 6 星期。
生物樣本庫
誰可以使用學院生物樣本庫？
香港大學李嘉誠醫學院 教職員符合資格並享有優先使用生物樣本庫服務的權利。其他港大教職員可透過電郵查詢：biobank.cpos@hku.hk。長期雪櫃儲存服務僅限港大醫學院教職員使用。
生物樣本庫提供哪些類型的服務？
生物樣本庫提供樣本儲存服務及部分樣本處理服務，例如從全血中分離血漿／血清／白細胞層、樣本分裝（分管）服務等。請發送電郵至 biobank.cpos@hku.hk 以商討您的需求。
生物樣本庫是如何管理的？
生物樣本庫由香港大學李嘉誠醫學院設立，作為其核心設施的一部分。生物樣本庫的日常營運及管理由泛組學科研中心 (CPOS) – 生物樣本庫設施團隊負責處理。
生物樣本庫對可儲存的物品是否有任何限制？
生物樣本庫將不會接受以下樣本：
-
- 在實驗室中培養，被世界衛生組織 (WHO) 定為第三級及第四級風險的微生物，例如甲型流感病毒株（如 H5N1 及 H7N9）、結核分枝桿菌、埃博拉病毒、馬爾堡病毒、猴疱疹病毒等；
- 已知具有顯著風險的第二級風險微生物高滴度儲存液，例如類鼻疽伯克霍爾德菌、百日咳博德特菌、白喉棒狀桿菌、腦膜炎奈瑟氏菌等；
- 已確認 攜帶上述微生物的臨床或環境樣本
- 放射性物質
在使用生物樣本庫之前，每位首席研究員 (P.I.) 及使用者均須簽署一份載有詳細資料的申報書。
費用是多少？
學院正為生物樣本庫的使用提供資助，同時部分營運成本將根據所消耗的資源進行收回。您可以在「收費標準」頁面上找到部分標準收費。如需其他服務，請發送電郵至 biobank.cpos@hku.hk 以作討論及索取報價。
如果我想使用生物樣本庫，應該如何開始？
請先瀏覽本網站上的資訊，然後發送電郵 至 biobank.cpos@hku.hk。
為方便有效跟進，請提供以下資訊：
- 您的姓名、部門及電話號碼
- 首席研究員 (P.I.) 的姓名、部門及電郵
- 樣本性質（例如全血、白膜層、血漿、血清、DNA、RNA、病毒、細菌）
- 樣本數量、來源及涉及的病原性
- 所需的儲存條件
- 若為樣本儲存，請提供現有的盒／容器類型及尺寸
- 其他特定需求
成像及流式細胞術設施
如何以使用者身份使用 PPMS？
請參閱此處的使用者指南。
如何以主管身份使用 PPMS？
請參閱此處的主管指南。
如何註冊存取影像及流式細胞術核心實驗室的數據傳輸服務器？
- 前往使用者註冊頁面： http://ifcs.cpos.hku.hk/share-drive/create_user.php
透過使用任何互聯網瀏覽器。- 電郵地址請僅填寫港大電郵（uid@hku.hk 或 uid@connect.hku.hk），請勿使用電郵別名 (Email Alias)。填寫您的全名及密碼。
- 點擊「Register（註冊）」以提交並生成確認電郵，該電郵將發送至您的港大電郵帳戶。
- 檢查您註冊的郵箱，尋找標題為「CPOS Imaging and Flow Cytometry Core Network Server Account Registration Confirmation」的電郵。
- 點擊所收到的電郵中的確認連結以完成註冊。
如何將數據上載至影像及流式細胞術核心實驗室服務器？
如何從影像及流式細胞術核心實驗室服務器下載數據？
如何重設影像及流式細胞術核心實驗室數據傳輸服務器的密碼？
重設密碼步驟：
- 使用互聯網瀏覽器開啟密碼重設頁面 (http://ifcs.cpos.hku.hk/share-drive/passwd.php)
- 輸入您的港大電郵地址
- 查看發送至您的港大郵箱的密碼重設電郵中的連結，並在該頁面中輸入新密碼以完成重設。
生物試劑及耗材採購設施
如何在網上訂購系統中下單？
請參閱 此處 的使用者指南。
生物試劑及耗材採購設施中儲備了哪些物品？
庫內備有來自 60 多個知名品牌的 20 多類常用耗材及試劑，包括細胞培養、微生物學、影像及流式細胞術、分子生物學以及實驗室日常運作的實驗耗材。詳細物品清單請參閱生物試劑及耗材採購設施的網上訂購系統 (BROS)。
是否可以在生物試劑及耗材採購設施 (BR Core) 中添加新物品？
歡迎提出新物品建議。請提供所需的產品詳情、消耗率及最新價格，並發送電郵至 bioreagent.cpos@hku.hk 供我們考慮。
送貨服務覆蓋哪些範圍？
送貨服務適用於瑪麗醫院及沙宣道校園（包括實驗室大樓、香港賽馬會跨學科研究大樓 [JCBIR]、臨床醫學研究中心 [CCMR]、中醫藥大樓）內各實驗室的訂單。至於其他地點的實驗室，請在訂單確認日起計 5 個工作天內安排從生物試劑及耗材採購設施的倉庫親身提取。
確認訂單後，何時可以收到產品？
對於實驗室大樓的訂單，已確認訂單中的物品將於 3 個工作天內送達（時間表可能會因實際情況而有所調整）。對於瑪麗醫院 (QMH)、JCBIR 及沙宣道沿線大樓的訂單，將按照網上訂購系統登入訊息中所顯示的時間表，於固定日期提供每週送貨服務。如需緊急提取，請透過電話或電郵與我們聯絡。
何時可以親身提取物品？
在緊急情況下，物品可供親身提取。服務時間為：上午 9:30 至 12:00；下午 14:00 至 17:00。請提前透過電話或電郵通知我們以安排親身提取。恕不接待即場登門 (Walk-in) 提取請求。
生物試劑及耗材採購設施的送貨單 (DN) 及每月發票需要什麼處理程序？
生物試劑及耗材採購設施發出的送貨單分為兩種：寄售送貨單 (Consignment Delivery Note) 及送貨單 (Delivery Note)。
寄售送貨單：適用於由生物試劑及耗材採購設施分發的寄售物品。相關供應商將適時向申購人發出發票。收到供應商發票後，應將該發票作為直接採購發票處理。付款程序須透過將經批署的發票提交至您的所屬部門，然後再提交至港大財務處 (FEO) 來啟動。
送貨單：適用於由生物試劑核心實驗室零售的物品。於每月初，實驗室將向研究組主管發出每月發票，以結算截至上月底所提取的所有訂單。費用將從訂購時提供的資助帳戶透過部門間轉帳結算。付款將由核心實驗室透過向港大財務處 (FEO) 提交每月綜合總額來啟動，因此請切勿自行將發票提交至港大財務處 (FEO)。
如何下單總金額超過審批限額的訂單？將訂單提交給主管後，我應該怎麼做？
金額超過審批限額的訂單須提交予主管審批。為取得主管批准，您可以選擇：1) 在訂單中夾附相應採購申請表 (IR) 的已批署打印本；或 2) 將訂單提交予您的主管，邀請主管在網上系統中批準該訂單；或 3) 發送電郵予您的主管以批準該項採購，並抄送 (cc) 至 bioreagent.cpos@hku.hk。
如何更改發票中的付款帳戶？
如需修改發票中的收費帳戶，請在發票日期起計 30 天內發送電郵至 enquiry.cpos@hku.hk，並提供以下資料：1) 發票編號 2) 研究組名稱 3) 物品請求編號 4) 新收費帳戶編號。
如何檢視各研究組的訂單及開支？
可在系統中生成研究組交易報告，以檢視訂單、物品詳情、帳戶詳情、單價、總金額等資料。如需生成報告，請點擊「Report（報告）」底下的「Group Transaction Report（研究組交易報告）」，並選擇適當的日期、供應商及研究組。
生物研究支援設施
如何以使用者身份使用 PPMS？
請參閱此處的使用者指南。
如何以主管身份使用 PPMS？
請參閱此處的主管指南。
如何註冊存取生物研究支援設施的數據傳輸伺服器？
1. 請使用任何互聯網瀏覽器前往使用者註冊頁面
http://ifcs.cpos.hku.hk/share-drive/create_user.php。
- 電郵地址請僅填寫港大電郵（uid@hku.hk 或 uid@connect.hku.hk），請勿使用電郵別名 (Email Alias)。填寫您的全名及密碼。
- 點擊「Register（註冊）」以提交並生成確認電郵，該電郵將發送至您的港大電郵帳戶。
- 檢查您的註冊郵箱，尋找標題為「CPOS Network Server Account Registration Confirmation」的電郵。
- 點擊收到的電郵中的確認連結以完成註冊。
如何將數據上載至核心實驗室生物研究支援設施的伺服器？
如何從生物研究支援設施的伺服器下載數據？
生物研究支援設施的標準作業程序 (SOP) — 在 macOS 上使用更新後的憑證存取數據傳輸伺服器 (DTS).
如需從非港大網絡下載數據，請在伺服器中對應硬碟（對應網絡磁碟機）之前先連接 HKUVPN 。
如何重設生物研究支援設施的數據傳輸伺服器的密碼？
重設密碼步驟：
- 使用互聯網瀏覽器開啟密碼重設頁面 (http://ifcs.cpos.hku.hk/share-drive/passwd.php)
- 輸入您的港大電郵地址
- 查看發送至您的港大郵箱的密碼重設電郵中的連結，並在該頁面中輸入新密碼以完成重設。
