技術概覽
Applied Biosystems (ABI) 3730xl DNA 分析儀
- 96 毛細管陣列提供高通量樣本處理
- 更高的光學靈敏度與先進的聚合物可提供更高質量的測序數據
- 經優化的聚合物亦可在不影響結果的情況下提高生產力
- 高準確度，並可分析長達 1,000 bp 的 DNA 序列
- 提供多種測序與片段分析應用，例如 DNA 測序、微衛星分析及 DNA 甲基化檢測等
染料組合選擇
目前 CPOS 使用濾光片組 G5 及 ABI PRISM Linkage Mapping Set DS-33，並配合以下螢光染料：
| 染料 | 顏色 |
| 6-FAM | 藍色 |
| VIC | 綠色 |
| NED | 黃色 |
| PET | 紅色 |
| LIZ （大小標準品） | 橙色 |
大小範圍
CPOS 常規提供 GeneScan™ 500 LIZ® 作為大小標準品。
此標準品適用於測定 35 至 500 個核苷酸範圍內的 DNA 片段大小。
工作流程
樣本製備與提交
成功的分析需要高品質的 DNA
樣本製備
純化樣本以去除過量的鹽分、有機溶劑及殘留乙醇
（通常可使用市售的 DNA 提取 / PCR 產物純化試劑盒）。
請遞交至少 2µl 的 DNA 樣本。
以黏性封膜密封盤，然後放入塑膠袋中包裹。
GeneScan 產品須避光保存。
樣本提交
請參閱「“用戶如何提出服務請求（Sanger 測序）」一節以了解進一步資訊。
- 請透過 iLab 提交服務請求
- 填妥 GeneScan 樣本提交表格.
- 每盤使用一份表格
- 清晰填寫所有資訊，否則工作將會延誤
- 數據質量控制需要每個樣本的預期讀段長度
- 透過 iLab 以附件形式提交「GeneScan 樣本提交表格」。
- 將樣本及「GeneScan 樣本提交表格」紙本遞交至 CPOS 接待櫃台 (6-02)
*請將表格釘在塑膠袋外側。
有關透過收集箱及速遞遞交的指示，請參閱 Sanger 網頁。
樣本收集時間
星期一至星期五（公眾假期和大學假期除外）
早上九時三十分至下午十二時三十分
下午二時至下午五時三十分
樣本編號 (Sample ID) 提交
請填妥電子版 GeneScan 樣本提交表格來提交樣本編號。
為每個樣本提供一個獨特的名稱。
透過 iLab 以附件形式提交「GeneScan 樣本提交表格」。
檔案命名格式為「日期 (yyyymmdd)_姓氏_名字」，例如 20080616_chan_peter
數據收集
GeneScan 結果將透過網上數據交付系統 (ODDS) 以壓縮檔形式發送給客戶，數據交付時將向服務請求表格上提供的電郵發送通知。
我們目前的處理時間為樣本遞交後的 1-2 個工作天。然而，由於不可預見的情況及繁忙的測序排程，處理時間有時可能會延長。
我們建議使用 ABI 的 GeneMapper v3.7 軟體進行微衛星分析。
此軟體可在 CPOS 6-01 室的其中一個用戶數據分析工作站 (User PC#2) 上使用。
客戶可透過我們的網上資源預訂系統 (ORBS) 或親臨接待櫃台 (6-02 室) 提前預訂工作站。
服務條款
重新測定政策
未能成功的 GeneScan 運行將接受內部 QC 審核。
若判定失敗原因與儀器相關（例如膠異常），樣本將自動免費重新運行，客戶無需額外付費。
若判定失敗原因與樣本相關，則不會進行重新運行。相反，CPOS 可提供諮詢服務，包括可能有助於改善 GeneScan 結果的合適方案。
我們的目標是為您提供最高品質的微衛星分析數據。
聯絡我們
Ms TSE, Christine
