數據分析工作站
數據分析工作站
CPOS 於 6-01 室設有 3 台 PC 用戶工作站,用於分析在 CPOS 生成的基因組學和蛋白質組學數據。CPOS 技術平台的用戶可於辦公時間在 CPOS 接待處(6-02 室)預約這些工作站,或通過我們的在綫資源預約系統(ORBS)進行預約。
我們提供軟件簡介課程。如有需要,請聯絡我們的平台專員。
CPOS 提供以下分析軟件:
| 軟件 | 使用領域 | 用戶 PC#2 工作站 * | 用戶 PC#5 工作站 * | 用戶 PC#7 工作站 * |
| 基因組學數據分析 | ||||
| Genome Studio | iScan | √ | ||
| GeneMapper 3.7 | Genescan | √ | ||
| GeneMapper 6.1 | Genescan | √ | ||
| PyroQ-CpG 1.0.9 | 焦磷酸測序 - 甲基化 | √ | ||
| PyroMark Assay Design 2.0 | 焦磷酸測序 - 分析設計 | √ | ||
| SeqScape 2.5.0 | DNA 測序 | √ | ||
| Sequence Scanner | DNA 測序 | √ | ||
| Agilent 2100 Expert | 生物分析儀 | √ | ||
| 新一代測序 (NGS) 數據分析 | ||||
| Partek Genomics Suite 6.6 with Partek Pathway | Illumina 數據集 | √ | ||
| 質譜分析 (MS) | ||||
| Foundation 3.1 SP9 | 代謝組學數據集 | √ | ||
| FreeStyle 1.8 SP2 QF1 | 代謝組學數據集 | √ |
* 此用戶 PC 運行於 Microsoft Windows XP 平台,且無互聯網連接。
指引
指引
CPOS 的數據分析工作站主要用於支持對在 CPOS 生成的數據進行分析。
負責此類數據分析的研究人員可註冊成為用戶。
註冊即表示用戶同意遵守以下指引。
首次分析會話前:
- 填妥「 在綫資源預約系統(ORBS)– 用戶帳戶申請表」
- 如有需要,請聯絡相關應的 CPOS 專員參加分析軟件簡介課程
注意:在設置 ORBS 用戶帳戶前,將對用戶身份進行核實。帳戶信息將通過電子郵件通知用戶。
每次分析會話前:
- 在 CPOS 接待處(6-02 室)或通過我們的線上資源預訂系統在綫資源預約系統(ORBS)預約您的分析時段
- 每位用戶最多可連續預約 3 小時
- 工作站開放時間:星期一至星期五,上午 9:30 至下午 12:30,下午 2:00 至下午 5:30,公眾假期除外
- 預約按照先到先得的原則進行
每次分析會話期間:
- 如有需要,請攜帶外部數據儲存設備和數據光盤
- 在 CPOS 接待處(6-02 室)登記
每次分析會話後:
- 將您所需要的所有數據全部導出至外部數據儲存設備
- 從軟件中刪除您的所有數據,以及從硬盤中臨時保存的數據
- 關閉電腦
其他重要事項:
- 工作站僅供數據分析使用。用戶不得安裝任何軟件、進行操作系統/軟件更新或調整任何設置。
- 為方便用戶使用,桌面上設有「Temp user data」文件夾,但不保證其中儲存數據的安全性。儲存的數據將在 3 天後刪除,恕不另行通知。
- 對於分析在 CPOS 生成的數據的用戶,可免費使用數據分析工作站。如需分析外部數據,將收取費用。詳情請向我們查詢。
軟件介紹課程
軟件介紹課程
我們為工作站上安裝的所有軟件提供介紹課程。
如有需要,請聯絡我們的平台專員。
| 軟件 | 聯絡電郵 | 電話 |
| 基因組學數據分析 | ||
| PyroQ-CpG | pyroseq.cpos@hku.hk | 2831-5467 |
| GeneMapper | sangerseq.cpos@hku.hk | 2831-5467 |
| Sequencing Analysis | ||
| 新一代測序 (NGS) 數據分析 | ||
| Partek Genomics Suite 6.6 with Partek Pathway | bioinfo.cpos@hku.hk | 2831-5418 |
| Partek Flow 與 Partek Pathway |
聯絡我們
bioinfo.cpos@hku.hk
地址
香港薄扶林
沙宣道 5 號
香港賽馬會跨學科研究大樓 6 樓
電話:2831-5500
傳真:2818-5653
網址:https://cpos.hku.hk
電郵: enquiry.cpos@hku.hk
辦公時間
星期一至五:上午九時至下午五時半
當中下午一時至兩時 - 不設樣本及貨品接收
星期六、日、大學假期和公眾假期休息

