硬件與存取

🖥️HPCF3 集群概覽

HPCF3 登入節點可透過 SSH 存取，主機名稱為：

hpcf3.cpos.hku.hk

點擊 按此 了解更多詳情。

🧰作業系統與軟件

所有 HPCF3 伺服器均運行於 Rocky Linux 8 作業系統。
廣泛使用的生物資訊學軟件已預先安裝，所有用戶均可使用。

⚙️ 服務

用戶透過集群的作業排程系統 OpenPBS 提交工作。作業僅透過 PBS 工作在運算節點上執行。

➡️ 注意：系統嚴禁直接登入運算節點。

👤用戶帳號設定

如欲申請帳戶，請聯絡 itsupport.cpos@hku.hk.

• 所有帳戶申請均須經 CPOS 審批及批准。
• 獲批准的用戶將獲得一個 HPCF3 集群的 Linux 帳戶。
• 每個帳戶預設提供 100 GB 儲存空間；如需額外配額，可另行提出申請，惟須視乎資源供應情況及相關收費而定。
• 每個帳戶僅供獲授權的 教職員或學生本人 使用—— 嚴禁與他人共用帳戶。
• 雖然儲存系統已具備硬件冗餘保護機制，CPOS 仍 強烈建議 用戶定期自行 備份資料。.
• 用戶應熟悉 Linux/UNIX 作業環境，並具備基本系統操作知識。ITS 已提供 參考指南 供用戶查閱及參考。

🔐集群登入

用戶可透過 SSH 用戶端（ PuTTY）進行遠端連線，網址如下： http://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/ 

連線詳情

若要連線到 HPCF3 的登入節點，請使用 SSH 用戶端，開啟 SSH 終端會話，命令如下: 

Hostname: hpcf3.cpos.hku.hk
Username:

🔒網路要求

基於安全考量，HPCF3 伺服器僅限從 香港大學網路 內部存取。

• 校外用戶必須先透過 HKUVPN連線。詳情請參閱：
  https://its.hku.hk/services/network-connectivity/hkuvpn/

📦資料傳輸

🪟 Windows 用戶

Windows 用戶可使用多款免費且成熟的圖形介面檔案傳輸工具，例如 WinSCP 或 FileZilla。透過這些工具，用戶只需以拖放方式，即可在集群前端節點與本機電腦之間輕鬆傳輸檔案。

🍏 Mac / 🐧 Linux 用戶

對於 Mac 或 Linux 用戶，命令列檔案傳輸工具 scp 通常已隨作業系統預先安裝。用戶可透過本機電腦的終端機（Terminal）連接至集群並傳輸檔案。
例如，假設用戶的 Mac 電腦上有一個名為 myfile 的本機檔案，並希望將其複製至集群帳戶的主目錄（Home Directory），可使用以下指令： 

例子：

 scp myfile userid@hpcf3.cpos.hku.hk:mydir/

此指令會將 myfile 複製至您 HPCF3 帳戶主目錄下的 mydir/ 目錄。

與其他以檔案或目錄作為參數的 Unix 指令一樣，來源及目的地路徑均可使用絕對路徑（以斜線 / 開頭）或相對路徑（不以斜線 / 開頭）來指定。 對於本機檔案或目錄，相對路徑是以目前工作目錄（Current Working Directory）為基準；而對於遠端檔案或目錄，相對路徑則是以遠端主機上的使用者主目錄（Home Directory）為基準。 

📡大量資料傳輸指南

為維持校園網路服務的穩定性，大量資料傳輸請遵循以下指引：

• 超過 30 GB 的對外資料傳輸應安排於非辦公時間進行。
• 如預計傳輸量超過 500 GB，請提前通知 itsupport.cpos@hku.hk，以便我們與 ITS 協調相關安排。

⚠️未事先通知的大型資料傳輸，可能導致 ITS 暫時封鎖集群伺服器的對外網際網路連線。