生物訊息設施

圖 1. Partek Flow 中用於數據分析的網頁版點擊式介面

圖 2. Partek Flow 中的分析視覺化範例

Partek Flow 與 Partek Pathway

Partek Flow 是一個基於網頁的分析工具（安裝在 CPOS 服務器上），每天 24 小時、每週 7 天均可使用。

單細胞分析

輸入數據類型（適用於使用 CPOS 10X 單細胞分析生成的基因表達數據）：

• 新一代測序（NGS）原始數據，例如：
  • FASTQ
• NGS 定量數據，例如：
  • 來自 10X Cell Ranger 的細胞計數矩陣
• NGS 處理後數據，例如（如適用）：
  • 來自 R/Seurat 的 RDS

主要特點：

• 使用多種標準格式導入和處理數據，並可在任何步驟導出數據
• 將細胞分類為已知和新型細胞類型
• 發現界定細胞群體的生物標誌物
• 找出差異表達基因和蛋白質
• 鑒定差異表達通路
• 比較實驗組之間的細胞類型群體
• 整合多組學實驗中的基因及蛋白質表達數據

您也可以訪問 Partek Flow 網站或查看在線文檔及教程，以了解更多詳情。

Bulk RNA-Seq 分析

輸入數據類型（適用於使用 CPOS 批量轉錄組學分析生成的基因差異表達結果檔案Bulk RNA-Seq 分析生成的差異基因表達結果文件）：

• 差異基因表達結果文件：
  • Partek_Gene_Diff.txt
  • Partek_Isoform_Diff.txt

主要特點：

• 導入和處理差異表達結果文件檔案，並可選擇在任何步驟導出數據
• 使用多種方法篩選基因列表，以進行下游數據分析
• 進行通路分析，以鑒定受影響的生物學過程
• 進行基因本體論基因本體論（GO）富集分析，以獲得功能方面的洞察
• 生成火山圖，以可視化差異表達

有關 Bulk RNA-Seq 分析的詳情，請參閱我們的用戶指南。

收費標準

Partek Flow 的收費標準包括軟件使用費和數據儲存費。詳情請聯絡聯絡我們。

軟件使用費：

• • 按日收費
  • CPOS 10X 用戶可豁免（受相關條款及條件約束）
  • CPOS Bulk RNA-Seq 分析用戶可豁免（受相關條款及條件受條款及細則約束）

數據儲存費：

• • 以 1000 GB 為單位按月計費
  • 請參閱 HPCF 帳戶的收費政策
  • CPOS Bulk RNA-Seq 分析用戶可豁免（受相關條款及條件受條款及細則約束）

請參閱 CPOS Partek Flow 預約指南，通過 iLab 預約服務。如果您首次使用 Partek Flow，請聯絡我們設置帳戶。